Біолог-аматор секвенував геном звичайної скалярії. Стаття про це опублікована в MicroPublication Biology.
Скалярія – це популярна акваріумна рибка. Вони відрізняються простотою утримання і активною турботою про потомство. Природний термін життя цих рибок обмежений приблизно десятьма роками.
Каліфорнійський школяр Індівер Мадіредді вперше провів повне секвенування цього виду риб. Як донор генного матеріалу виступила його власна акваріумна скалярія, яка померла від старості. За словами школяра, таким чином він хотів «увічнити пам’ять» про вихованця. Мадіредді використовував обладнання Oxford Nanopore Technologies у громадській лабораторії BioCurious у Санта-Кларі, Каліфорнія. Ця організація надає у користування обладнання для біологічних дослідів за порівняно невелику (порівняно з вартістю техніки) пожертву. Гроші школяру допомогли зібрати люди, які співчували, за допомогою краундфандингу.
Розмір геному скалярії та відсотковий вміст гуаніну та цитозину в молекулах виявилися аналогічними до інших видів риб, таких як азіатський морський окунь (Lates calcarifer) і нільська тіляпія (Oreochromis niloticus). Більше половини (59 відсотків) ідентифікованих генів виявилися ортологічними для цихлозом колючої (Archocentrus centrarchus), близькоспорідненої американської цихліди. Ймовірно, ці види розділилися у період 28,7 та 72,4 мільйонів років тому.
